Ce document est une mise au point des infections urinaires de l’adulte (cystites et pyélonéphrites) selon les principales situations cliniques, incluant les antibiotiques recommandés, leurs posologies et durées, conformément aux recommandations récentes (SPILF, AFU, HAS).
Définitions et physiopathologie
- Cystite aiguë : infection bactérienne du bas appareil urinaire (vessie) se manifestant par des signes urinaires locaux sans atteinte systémique sévère.
- Pyélonéphrite aiguë (PNA) : infection bactérienne du parenchyme rénal (haut appareil), généralement ascendante depuis la vessie, pouvant s’accompagner de fièvre et de signes généraux
Germes communautaires les plus fréquents :
- Escherichia coli – principal germe dans ~75-90% des cas (cystite & pyélonéphrite).
- Staphylococcus saprophyticus – surtout chez la femme jeune.
- Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Entérocoques et parfois Pseudomonas.
- Les bactéries productrices de β-lactamases à spectre étendu (BLSE) deviennent de plus en plus fréquentes, influençant le choix des antibiotiques.
1. Cystite aiguë simple
Femme adulte non enceinte, sans comorbidité ni facteur de complication. L’ECBU n’est pas systématique en cas de tableau clinique typique.
Antibiothérapie de première intention
| Antibiotique | Posologie | Durée |
| Fosfomycine-trométamol | 3 g per os | Dose unique |
| Nitrofurantoïne | 100 mg x 2/j | 5 jours |
| Pivmécillinam | 400 mg x 2 à 3/j | 5 jours |
Alternatives
| Antibiotique | Posologie | Durée |
| Triméthoprime-sulfaméthoxazole* | 160/800 mg x 2/j | 3 jours |
*Utilisation possible uniquement si le taux de résistance locale d’Escherichia coli est inférieur à 20 %.
Les fluoroquinolones et les céphalosporines de 3e génération ne sont pas recommandées en première intention.
2. Cystite récidivante
Définie par au moins 4 épisodes par an ou 2 épisodes en 6 mois. Un ECBU est obligatoire avant toute antibiothérapie.
Traitement curatif
Identique à celui de la cystite aiguë simple, adapté à l’antibiogramme.
Prévention (au cas par cas)
- Traitement post-coïtal : nitrofurantoïne 100 mg en dose unique
- Traitement continu pendant 6 mois :
- Nitrofurantoïne 50 à 100 mg/j
- Triméthoprime-sulfaméthoxazole 40/200 mg/j
3. Cystite chez l’homme
Toute infection urinaire chez l’homme est considérée comme compliquée. Un ECBU est systématique.
| Antibiotique | Posologie | Durée |
| Nitrofurantoïne* | 100 mg x 2/j | 7 jours |
| Triméthoprime-sulfaméthoxazole | 160/800 mg x 2/j | 7 jours |
| Fluoroquinolone (si atteinte prostatique suspectée) | Ciprofloxacine 500 mg x 2/j | 10 à 14 jours |
*La nitrofurantoïne est inefficace en cas de prostatite associée.
4. Pyélonéphrite aiguë simple
Femme adulte stable, sans signe de gravité. ECBU systématique avant antibiothérapie.
| Antibiotique | Posologie | Durée |
| Ciprofloxacine | 500 mg x 2/j | 7 jours |
| Lévofloxacine | 500 mg x 1/j | 7 jours |
| Triméthoprime-sulfaméthoxazole | 160/800 mg x 2/j | 14 jours |
En cas de résistance locale élevée aux fluoroquinolones, une dose initiale de ceftriaxone IV peut être administrée avant relais oral.
5. Pyélonéphrite grave ou compliquée
Inclut les formes avec sepsis [Voir définition sepsis], vomissements, terrain à risque, grossesse ou infection chez l’homme. Hospitalisation requise.
Antibiothérapie probabiliste intraveineuse
| Antibiotique | Posologie |
| Ceftriaxone | 1 à 2 g IV/j |
| Cefotaxime | 1 g IV x 3/j |
| Amikacine (si forme sévère) | 15 mg/kg en dose unique |
Suspicion de BLSE
- Ertapénem 1 g IV/j
- Imipénem ou méropénem selon protocole
Relais oral après 48 à 72 heures d’amélioration clinique. Durée totale du traitement : 10 à 14 jours.
6. Infections urinaires et grossesse
Cystite chez la femme enceinte
ECBU systématique avant et après traitement.
| Antibiotique | Posologie | Durée |
| Fosfomycine-trométamol | 3 g per os | Dose unique |
| Nitrofurantoïne | 100 mg x 2/j | 5 jours |
| Amoxicilline-acide clavulanique | 1 g x 2 à 3/j | 5 à 7 jours |
| Céfuroxime ou céfixime | Dose standard | 5 à 7 jours |
Les fluoroquinolones, cyclines et le triméthoprime-sulfaméthoxazole sont contre-indiqués au premier trimestre et en fin de grossesse.
Pyélonéphrite gravidique
Hospitalisation obligatoire. Traitement par céphalosporine de 3e génération IV, avec relais oral après amélioration. Durée totale : 10 à 14 jours.
Règles essentielles
- ECBU avant antibiothérapie si homme, grossesse, pyélonéphrite ou récidive
- Réévaluation clinique à 48–72 heures
- Pas d’ECBU de contrôle systématique hors grossesse
- Adapter systématiquement à l’antibiogramme
Lisez notre article "Antibiotiques essentiels"
Bibliographie
- Société de Pathologie Infectieuse de Langue Française (SPILF). Recommandations pour la prise en charge des infections urinaires communautaires de l’adulte. 2023. infectiologie.com
- Association Française d’Urologie (AFU). Infections urinaires de l’adulte : recommandations pratiques. Site urofrance
- Haute Autorité de Santé. Infections urinaires bactériennes chez l’adulte. Recommandations de bonne pratique. 2022. has-sante.fr
- Gupta K, Hooton TM, Naber KG, et al. International clinical practice guidelines for the treatment of acute uncomplicated cystitis and pyelonephritis in women. Clin Infect Dis. 2011;52(5):e103–e120.
- Bonkat G, Bartoletti R, Bruyère F, et al. EAU guidelines on urological infections. Eur Urol. 2025.
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